Organy Arbitrażu Prezesa Państwowego Arbitrażu Gospodarczego powoływał i odwoływał Prezes Rady Ministrów. Zastępcami Prezesa Państwowego Arbitrażu Gospodarczego byli wiceprezesi, których powoływał i odwoływał Prezes Rady Ministrów na wniosek Prezesa Państwowego Arbitrażu Gospodarczego. Prezes Państwowego Arbitrażu Gospodarczego kierował Główną Komisją Arbitrażową oraz nadzorował okręgowe komisje arbitrażowe.
Rada Państwowego Arbitrażu Gospodarczego W Głównej Komisji Arbitrażowej działała Rada Państwowego Arbitrażu Gospodarczego.
W skład Rady Państwowego Arbitrażu Gospodarczego wchodzili Prezes jako przewodniczący, wiceprezesi Państwowego Arbitrażu Gospodarczego oraz dwudziestu członków, powołanych na okres trzech lat przez Prezesa Rady Ministrów na wniosek Prezesa Państwowego Arbitrażu Gospodarczego spośród pracowników nauki i praktyków.
Rada Państwowego Arbitrażu Gospodarczego ustalała ogólne wytyczne orzecznictwa arbitrażowego oraz dokonywała oceny przedstawionych przez Prezesa Państwowego Arbitrażu Gospodarczego kierunków tego orzecznictwa.