W 2019 roku objęła funkcję szefowej konferencji Republikanów w Izbie Reprezentantów.
12 maja 2021 roku członkowie Partii Republikańskiej pozbawili ją stanowiska szefowej konferencji Republikanów w Izbie Reprezentantów niezadowoleni z ciągłej krytyki byłego prezydenta Stanów Zjednoczonych Donalda Trumpa, obwiniania go o przyczynienie się do ataku na Kapitol Stanów Zjednoczonych i wzywania do wszczęcia śledztwa w tej sprawie. Została zastąpiona Elisą Stefanik, zwolenniczką teorii o sfałszowanych wyborach w 2020 roku. 30 czerwca była jednym z dwojga Republikanów (drugim był Adam Kinzinger), którzy zagłosowali za utworzeniem Komisji Specjalnej do zbadania ataku z 6 stycznia na Kapitol Stanów Zjednoczonych i po jej utworzeniu objęła funkcję wiceprzewodniczącej.
W 2022 roku nie uzyskała nominacji Partii Republikańskiej w wyborach do Izby Reprezentantów. Przegrała partyjne prawybory z Harriet Hageman, którą publicznie popierał Donald Trump. Liz Cheney wyraziła opinię, że amerykańska demokracja nie jest pewna, póki Donald Trump angażuje się w politykę, i zapowiedziała, że zrobi wszystko, by go powstrzymać.