W czasie okupacji włoskiej i niemieckiej nie prowadził działalności politycznej.
Po przejęciu władzy przez komunistów, 9 lutego 1945 Rexhep Jella został aresztowany. Zarzucano mu współpracę z oficerami misji brytyjskiej działającej w czasie wojny na terytorium Albanii, a także służbę w administracji króla Zoga I. 1 listopada Sąd Wojskowy skazał go na 2 lata więzienia. W lipcu 1947 ponownie aresztowany pod zarzutem współpracy z politykami antykomunistycznymi. W grudniu skazany na 5 lat więzienia i konfiskatę majątku. Willa w Tiranie, w której mieszkał została przekazana do dyspozycji radzieckiego pułkownika, który należał do grona doradców Envera Hodży. Karę odbywał w więzieniu w Burrel. Po uwolnieniu mieszkał w zrujnowanym domu na przedmieściach Kavai w skrajnej nędzy. Zmarł w 1974.
Działalność sportowa Był jednym z pierwszych piłkarzy w Albanii i organizatorem albańskiej federacji piłkarskiej. Po jej utworzeniu w 1930 objął funkcję przewodniczącego. Był także organizatorem federacji lekkoatletycznej w Albanii, organizując pierwsze zawody lekkoatletyczne w Tiranie.
Życie prywatne Był żonaty (żona Fetie z d. Beshiri), miał troje dzieci.