Zatrzymała ich dopiero naszpikowana gwiazdami reprezentacji Stal Mielec. W sezonie 1988/1989 GKS Jastrzębie grał w I lidze, uzyskując awans po zwycięskim barażu z Piastem Nowa Ruda. 14. miejsce wśród najlepszych polskich drużyn nie pozwalało na utrzymanie i po przegranych meczach barażowych z Zawiszą Bydgoszcz GKS Jastrzębie powrócił do II ligi. Rok później klub zanotował kolejny spadek, tym razem do III ligi gdzie występował do 2007 r., z krótką dwuletnią przerwą (lata 2002–2004 spędzone w IV lidze).Awansował do II ligi piłkarskiej 26 Maja 2007 r. Po wygranym meczu z GKS Katowice. W roku 1999 nastąpiła zmiana nazwy klubu na MKS (Miejski Klub Sportowy) Górnik Jastrzębie, który w roku 2005 został przemianowany na MKS (Miejski Klub Sportowy) GKS Jastrzębie. W sezonach 2007/2008 i 2008/2009 zespół występował w II lidze (nowa I liga), jednakże po wygranych barażach nie uzyskał licencji na grę na zapleczu ekstraklasy. W kolejnym sezonie 2009/2010 występował w nowej II lidze (3 poziom rozgrywkowy w Polsce), jednakże wskutek problemów finansowych i organizacyjnych drużyna uległa rozwiązaniu. Dzięki pomocy działaczy Gosława Jedłownik w sezonie 2010/2011 drużyna z Jastrzębia występowała w lidze okręgowej formalnie jako KS Gosław Jedłownik i uzyskała awans do Ligi Śląskiej. W czerwcu 2011 r.