Wełnianka uszatego zalicza się do plemienia Vampyrini w obrębie podrodziny liścionosów (Phyllostominae). Do tego samego plemienia przydziela się widmowca wielkiego (Vampyrum spectrum) i dwa gatunki z rodzaju mimon (Mimon); do roku 2014 zaliczano tu jeszcze trzy inne gatunki nietoperzy, nadawano im przynależność do rodzaju Mimon, ale obecnie klasyfikuje się je w rodzaju Gardnerycteris i plemieniu Phyllostomini.
Nazwa Chrotopterus pochodzi z greki i oznacza „skóroskrzydły” od gr. χρως khrōs, χρωτος khrōtos „skóra”; -πτερος -pteros „-skrzydły”, od πτερον pteron „skrzydło”. Natomiast auritus tłumaczy się jako „z wielkimi uszami”, „długouchy”.
Występowanie Gatunek szeroko rozprzestrzeniony, występuje od południowego Meksyku (od stanów Veracruz i Oaxaca oraz półwyspu Jukatan) przez Amerykę Centralną do Ameryki Południowej tj. Kolumbii, Wenezueli, krajów regionu Gujana (Gujana, Surinam i Gujana Francuska), Brazylii, Ekwadoru, wschodniego Peru, Boliwii, Paragwaju i północnej Argentyny;