Budowa i kwalifikacje genologiczne Misterium niedzielne składa się z czterech widowisk przedzielonych Intermedium. Odwrotnie niż w tradycyjnym misterium Intermedium ma bardziej poważny i refleksyjny charakter, natomiast sceny (widowiska) są bardziej ludyczne. Tytuł utworu jest wyraźnym nawiązaniem do formy misterium, szczególnie popularnej w średniowieczu. Misterium niedzielne bywa jednak różnorako określane – jako utwór liryczny lub dramatyczny bądź jako gatunek z pogranicza: „poemat dramatyczny”, „groteska dramatyczna”, „misterium-buffo”, „antymisterium”, „dramat poetycki”, „widowisko poetyckie”, „śpiewogra”. Niemniej w utworze Gajcego można rzeczywiście odnaleźć zasadnicze cechy stosunkowo mało restrykcyjnego gatunku misterium: szeregowa konstrukcja akcji dramatycznej; cykliczność budowy; mechaniczne łączenie scen i epizodów; równorzędne traktowanie wszystkich postaci; skłonność do mieszania kategorii komizmu i wzniosłości; symultaniczna przestrzeń teatralna; obraz historyczny znany widzom w znacznej części, budowany przy pomocy prostych, często umownych, środków; fragmentaryczność.