Dyrektor i pracownicy instytutu nie mogli wchodzić w skład Rady.
Do zakresu działania Rady Naukowej należało: inicjowanie prac naukowo-badawczych; opiniowanie planów prac oraz preliminarzy dochodów i wydatków instytutu; wypowiadanie się w sprawach dotyczących organizacji instytutu; rozpatrywanie innych spraw na zlecenie Prezesa Rady Ministrów, Prezesa Głównego Urzędu Pomiarów Kraju lub na wniosek przewodniczącego Rady.
Organizacja Instytutu Komórki organizacyjne instytutu dzieliły się na naukowe i usługowe.
Komórki naukowe realizowały zasadnicze zadania instytutu, określone w statucie. Komórki usługowe wykonywały funkcje pomocnicze w stosunku do komórek naukowych,
Organizacja wewnętrzna instytutu przedstawiała się następująco: Starszy Planista, Sekcja Budżetowo-Gospodarcza, Działowy Ośrodek Dokumentacji Naukowo-Technicznej i Biblioteka, Zakład Geodezji, Zakład Geofizyki, Zakład Fotogrametrii, Zakład Astronomii, Zakład Pomiarów Odkształceń, Zakład Kartografii, Dział Organizacji Pracy i Analizy Procesu Geodezyjnych.
Instytut prowadził zakłady naukowo-badawcze i doświadczalne, pracownie pomocnicze oraz zespoły dla prac terenowych.