Przed atakiem na Pearl Harbor dowodził dywizjonem niszczycieli pilnujących konwojów płynących na Islandię.
Na początku 1942 roku Fahrion był dowódcą grupy niszczycieli osłaniających lotniskowiec USS Yorktown. Odznaczony Brązową Gwiazdą. Po powrocie do Stanów Zjednoczonych, w grudniu 1942 roku, pełnił tymczasową służbę w w Waszyngtonie. W lutym następnego roku zgłosił się jako inspektor ds. uzbrojenia marynarki wojennej (Inspector of Naval Ordnance in Charge) w Naval Torpedo Station w Newport na Rhode Island. Za służbę na tym stanowisku został odznaczony Legią Zasługi. Od sierpnia do października 1944 roku pełnił służbę na USS New Jersey na Pacyfiku, a 6 października tego samego roku objął dowództwo nad okrętem USS North Carolina. Jako dowódca USS North Carolina został odznaczony Brązową Gwiazdą za waleczność. Do końca wojny pełnił misje na oceanie. Pod koniec prowadzenia działań zbrojnych, już jako kontradmirał, został odznaczony Złotą Gwiazdą.
W styczniu 1947 roku został mianowany generalnym inspektorem Floty Pacyfiku, które to stanowisko pełnił do lipca 1950 roku, gdy objął dowództwo nad wszystkimi niszczycielami przydzielonymi do Floty Atlantyku.