W 2016 roku Akwarium zanotowało rekordowy wynik frekwencji: 504 040 zwiedzających.
Edukacja - Akwarium prowadzi szeroką gamę zajęć dla grup zorganizowanych. Co roku z lekcji o środowisku morskim korzysta około 40 tysięcy osób. W ofercie znajduje się kilkadziesiąt tematów prezentowanych w postaci zajęć laboratoryjnych, terenowych lub wykładów. Są one dostosowane do osób w każdym wieku, a ich uczestnicy to nie tylko dzieci i młodzież, ale też grupy seniorów. Oprócz kilkudziesięciu tematów, Akwarium przygotowuje zajęcia w oparciu o konsultacje z wychowawcami, biorąc pod uwagę potrzeby ich podopiecznych. Odbiorcami są również osoby niedosłyszące, niewidome oraz z niepełnosprawnościami intelektualnymi.
Organizowanie wydarzeń specjalnych i budowanie społeczności - Misję edukacyjną Akwarium realizuje również poprzez budowanie społeczności ludzi, którym na sercu leży dobro środowiska wodnego. W ramach tych działań w Akwarium działają Klub Młodego Odkrywcy Mórz oraz Klub Podróżników. W 2015 roku Akwarium Gdyńskie podjęło się zadania wprowadzenia idei Ocean Literacy w Polsce.