Klasztornej z rzeką Wisłą w kierunku wschodnim środkiem rzeki Wisły do przecięcia z granicą miasta, – dalej na południe granicą m. Krakowa do przecięcia z rzeką Drwiną Długą, z Dzielnicą XII graniczy na odcinku – od skrzyżowania granicy m. Krakowa z rzeką Drwiną Długą w kierunku zachodnim, północną stroną rzeki Drwiny Długiej do skrzyżowania z granicą pomiędzy obrębami nr: 25 i 26, dalej w kierunku południowym granicą pomiędzy obrębami nr: 25 i 26 do północnej granicy st. tow. Kraków Prokocim, dalej na wschód, północną stroną st. tow. Kraków Prokocim do granicy pomiędzy obrębami Nr 54 i 52, przecina kolej na południe granicą pomiędzy obrębami Nr: 54 i 52 do styku granic obrębów nr: 52, 53 i 54 (rejon ul. Balickiego), dalej w kierunku zachodnim granicą pomiędzy obrębami nr: 52 i 53 do przecięcia z ul. Wielicką (rejon ul. Świątnickiej), z Dzielnicą XI graniczy na odcinku – wzdłuż ulicy Kamieńskiego – wprowadzona została dokonaną w roku 2014 korektą granic dzielnicy. „Trzynastka” zyskała wtedy tereny znajdujące się do tej pory w obszarze Dzielnicy XI Podgórze Duchackie (okolice ul. Heltmana, Pańskiej, Stoigniewa, Dauna, rezerwat „Bonarka”). Wcześniej obowiązująca i nadal utrwalony w wielu miejscach przebieg to, od skrzyżowania granic pomiędzy obrębami nr: 52 i 53 (rejon ul. Świątnickiej) z ul.