mały|Leopold Wackarž – opat klasztoru, opat generalny cystersów do 1900 r. Absolutystyczne rządy Józefa II w typie oświeceniowym, przyniosły kasaty klasztorów, konfiskaty ich majątków oraz ograniczenie ich praw, równolegle z nakładaniem szeregu obowiązków właściwych dla administracji publicznej – księża byli np. zmuszani do sporządzania spisów ludności, do nauczania. W 1784 roku z woli Józefa w opactwie prowadzono wywołane donosem pracownika klasztoru dochodzenie. Dwa lata później w jego wyniku ze stanowiska usunięto opata Hermana Kurza, na jego przywrócenie zgodę wyraził natomiast następny cesarz – Leopold II. Na klasztor nałożono obowiązek wysyłania pięciu profesorów filozofii na potrzeby gimnazjum państwowego w Czeskich Budziejowicach. W czasie tym część klasztornego majątku została skonfiskowana, kasaty opactwo uniknęło natomiast prawdopodobnie przez swoje długi, które w wyniku jego likwidacji musiałoby spłacić państwo.
Pod koniec XVIII w. wspólnota klasztorna liczyła 65 zakonników, natomiast nałożony na nią limit państwowy wynosił 18, co oznaczało niemożliwość przyjmowania nowicjuszy, aż do czasu jego zniesienia w 1789 r.