Sąd rejestrowy może odmówi rejestracji, jeżeli treść statutu wskazuje, że organizacja nie jest związkiem zawodowym rolników indywidualnych w rozumieniu ustawy albo postanowienia statutu są niezgodne z jej przepisami.
W przypadku zmiany statutu właściwy organ związku zawodowego rolników indywidualnych ma obowiązek niezwłocznie zawiadomić sąd rejestrowy o zmianie statutu.
Wykreślenie związku zawodowego z rejestru Sąd rejestrowy może wykreślić związek zawodowy rolników indywidualnych z rejestru: w razie podjęcia, w sposób przewidziany w statucie, uchwały o rozwiązaniu związku; jeżeli liczba członków związku jest mniejsza od liczby określonej w ustawie.
Związki działające na podstawie ustawy mają prawa i obowiązki, jakie przepisy ustaw przyznają społeczno-zawodowym organizacjom rolników w zakresie reprezentacji i obrony praw oraz interesów rolników.
Organy państwowe i samorządowe są obowiązane traktować na równi wszystkie związki zawodowe rolników indywidualnych i społeczno-zawodowe organizacje rolników w zakresie ich działalności.
Uprawnienia związków zawodowych Związki zawodowe rolników indywidualnych uprawnione są przystępować do: międzynarodowych organizacji rolniczych; ponadnarodowych organizacji rolniczych reprezentujących interesy zawodowe rolników indywidualnych wobec instytucji Unii Europejskiej.