Śmieja jest autorem bądź współautorem dwóch monografii i ponad 150 publikacji naukowych. Aktywnie uczestniczył w pracach naukowo-badawczych, prowadzonych we współpracy z partnerami naukowymi i przemysłowymi, krajowymi i zagranicznymi. Z ciekawszych wymienić można m.in. udział w projekcie Chernobyl Tissue Bank (CTB), finansowanym ze środków Unii Europejskiej czy kierowanie projektem Zintegrowany system informatyczny wspomagający badania nad nowotworami pochodzenia środowiskowego (SYSCANCER), finansowanym przez Narodowe Centrum Badań i Rozwoju (NCBiR).
Śmieja był wielokrotnym promotorem przewodów doktorskich, a także recenzentem prac doktorskich i rozpraw habilitacyjnych.
Działalność dydaktyczna Wykłada na Politechnice Śląskiej, na studiach inżynierskich, magisterskich i doktoranckich, a także w Wyższej Szkole Technologii Informatycznych (WSTI) w Katowicach. Jego zajęcia na stopniu inżynierskim i magisterskim, prowadzone w językach polskim i angielskim na kierunkach Automatyka i Robotyka, Biotechnologia (Bioinformatyka) oraz Control, Electronic and Information Engineering, związane były przede wszystkim z wykorzystaniem metod matematycznych w praktyce inżynierskiej (m.in. przedmioty Dynamika Układów, Podstawy Automatyki, Teoria Sterowania, Metody Optymalizacji, Bioinformatyka). Prowadził również wykłady dla doktorantów, m.in.