Kariera trenerska Walter Köberle po zakończeniu kariery sportowej rozpoczął karierę trenerską. W sezonie 1984/1985 roku prowadził Düsseldorfer EG U-20, a w latach 1986–1993 prowadził w Düsseldorfer EG drużyny U-16, U-18 i U-20.
W 1991 roku wraz z Friedhelmem Raspelem wydał książkę pt. „Hokej na lodzie – od juniora do mistrza”. W latach 1991–1992 był asystentem selekcjonera Jima Settersa w reprezentacji Niemiec U-18. W sierpniu 1993 roku został trenerem Eisbären Berlin, jednak przed rozpoczęciem sezonu 1993/1994 z powodów zdrowotnych musiał zrezygnować z tej funkcji. W sezonie 1994/1995 prowadził występujący w I lidze niemieckiej Neusser SC, a w latach 1995–1997 prowadził występującego w tych samych rozgrywkach EV Duisburg.
Po awansie Düsseldorfer EG do ligi DEL w sezonie 1999/2000, był w sezonie 2000/2001 asystentem trenera Gerharda Brunnera w tym klubie, równocześnie będąc menedżerem generalnym w reprezentacji Niemiec U-18.
W październiku 2004 roku został trenerem DEG Metro Stars, jednak po trzech meczach w sezonie 2004/2005 został zastąpiony przez Butcha Goringa.