7 maja 1944 roku, w kwaterze dozorcy cmentarza Adriana Sikorskiego w Grudziądzu, został aresztowany przez gestapo, bezpośrednio po aresztowaniu jego najbliższego współpracownika Józefa Sierosławskiego ps. „Grad”. Został aresztowany w wyniku przechwycenia przez Niemców kopii jego meldunków wywiadowczych dotyczących przemysłu zbrojeniowego. Został przewieziony do siedziby gestapo w Łodzi przy ul. Austädta. Podczas przesłuchiwań był torturowany i konfrontowany z członkami pomorskiego wywiadu ZWZ-AK. Ze względu na bardzo duże znaczenie jego działalności konspiracyjnej na Pomorzu był przesłuchiwany do połowy stycznia 1945 roku. Podczas transportu więźniów, zdołał zbiec w Szadku.
Pod koniec lutego 1945 roku dotarł do Bydgoszczy, gdzie spotkał się z rodziną i wracał do zdrowia. W marcu 1945 roku nawiązał kontakt z organizatorami Pomorskiego Okręgu Delegatury Sił Zbrojnych na Kraj (DSZ): ppłk. Janem Pałubickim i mjr. Józefem Chylińskim.