Witraże mały|Witraże zaprojektowane przez o. Efrema dla Kościoła św. Józefa w Inowrocławiu. Wykonane w latach 1951–1958. O. Efrem zaprojektował witraże dla kościoła kapucynów w Marsylii (został rozebrany w latach 70. XX wieku). W kościele św. Józefa w Inowrocławiu znajdują się witraże zaprojektowane przez o. Efrema w latach 1938–1939 i wykonane przez pracownię Stanisława Powalisza w Poznaniu (część wykonano po II wojnie światowej w latach 1951–1958)Natanaela Wiesława Błażejczyk, Witraże w kościele pw. Św. Józefa w Inowrocławiu, w: Zanurzony w pięknie. Efrem Maria z Kcyni, s. 221–231.. W roku 1967 zaprojektował również witraże dla kościoła pw. Św. Michała Archanioła w Kcyni.
Dzieła malarskie O. Efrem wykonał wiele dzieł malarskich w różnych technikach: akwarele, freski, malarswo olejne, pastele. Poświęcone były one zarówno tematyce sakralnej, jak również świeckiej (portrety, pejzaże).