W przedsięwzięciu wzięli udział dyrygenci Paul Goodwin, Christophe Rousset, Eivind Gullberg Jensen, Evelino Pidò. Sam Jan Tomasz Adamus poprowadził IX Symfonię.
Jako organista i dyrygent jest autorem licznych nagrań. Na płytach znaleźć można zarejestrowane przez niego opery barokowe (m.in. fonograficzne prapremiery Germanico in Germania Porpory i Adriano in Siria Pergolesiego wydane przez wytwórnię Decca), dawną muzykę polską oraz repertuar klasyczny i romantyczny wykonywany na instrumentach z epoki (Requiem Mozarta, utwory Chopina, Schuberta i Karłowicza, Halka Moniuszki w jej pierwotnej, „wileńskiej” wersji). Współpracował z takimi śpiewakami i śpiewaczkami jak Waltraud Meier, Thomas Hampson, Ian Bostridge, Mark Padmore, Jakub Józef Orliński, Franco Fagioli czy Núria Rial. Jest dyrektorem artystycznym festiwali Opera Rara Kraków, 6 Tygodni oraz Festiwalu Bachowskiego Świdnica.