woda do meczetu była doprowadzana z akweduktu Walensa osobnym mniejszym akweduktem, dzięki któremu woda płynęła poniżej poziomu gruntu i widok na meczet od północy nie był zasłonięty. W układzie meczetu Hagia Sofia zastosowano symetrię osiową, którą Sinan w projekcie meczetu Şehzade przekształcił w symetrię promienistą opartą o .
Dominującym elementem budowli jest centralnie położona kopuła o średnicy 18,42 m wsparta na czterech kolumnach, otoczona przez cztery półkopuły. Takie rozwiązanie zostało wcześniej wykorzystane przy budowie . Łącznie budynek nakrywa 16 kopuł. Budowla jest oflankowana dwoma galeriami. Do wnętrza kompleksu prowadzi 5 wejść, z czego do samego meczetu można wejść trzema drzwiami. Nad wejściem głównym znajduje się napis: Mabed-i Ümmet-i Rasûl-i Mûbin – rok 955. W narożniku meczetu znajduje się zielona kamienna kolumna, tzw. „środek Stambułu”.
We wnętrzu znajdują się cztery duże kolumny i kilka mniejszych. Dekoracje wnętrz stanowią malowidła kaligraficzne, elementy z barwionego szkła oraz mukarnas w przejściach pomiędzy narożnikami. Minbar i mihrab zostały wykonane z marmuru.
Przy meczecie znajdują się dwa minarety z dwoma w północnowschodnim i północnozachodnim narożniku;