Po zajęciu miejscowości przez Armię Czerwoną zdołał uciec, po czym przedostał się przez Litwę i Szwecję do Francji, gdzie wstąpił do Wojska Polskiego i służył w dywizjonie rozpoznawczym 4 Dywizji Piechoty.
W 1940 został ewakuowany do Wielkiej Brytanii i otrzymał przydział do 10 Pułku Strzelców Konnych. Po wejściu 10 Pułku Strzelców Konnych w skład 1 Dywizji Pancernej gen. Maczka jako pułku rozpoznawczego brał udział w walkach na kontynencie europejskim, pełniąc funkcję dowódcy szwadronu dowodzenia, w którego skład wchodziły plutony: czołgów, techniczno-gospodarczy, przeciwlotniczy, łączności oraz rozpoznawczy. Uczestniczył w kampaniach we Francji, Belgii i Holandii. We wrześniu 1944 został awansowany do stopnia rotmistrza. 5 maja 1945 jego pułk zakończył działania bojowe na terenie Niemiec.
W maju 1945 Jerzy Iwanowski objął stanowisko komendanta Polish 3 Remount Depot, jednej z trzech stacji zbornych gromadzących rasowe konie wywiezione przez Niemców z Polski;