W sezonie 1991/92 zespół debiutował w rozgrywkach mistrzostw Niemiec na najwyższym szczeblu, zajmując drugie miejsce w grupie północnej Bundesligi. W turnieju finałowym dotarł do finału. W kolejnych pięciu sezonach klub zawsze kwalifikował się do turnieju finałowego, a w sezonie 1996/97 po raz pierwszy został mistrzem Niemiec, wygrywając w finale w rzutach karnych 5:3 (1:1 po dogrywce) z FC Rumeln-Kaldenhausen. Tydzień później klub zdobył puchar, pokonując 3:1 Eintracht Rheine. W tamtym roku zdobył również Superpuchar po raz drugi. W kolejnych sezonach plasował się w środku tabeli najlepszych niemieckich klubów piłkarskich. 1 lipca 2000 roku sekcja piłki nożnej kobiet SV Grün-Weiß Brauweiler stała się nazywać FFC Brauweiler Pulheim. W sezonie 2003/04 zespół zajął przedostatnie miejsce i spadł na rok do 2. Bundesligi. Powrót na najwyższy poziom był nieudanym, po jednym sezonie klub spadł w 2007 do 2. Bundesligi, a rok później do Verbandsliga Mittelrhein (D3). W dniu 9 kwietnia 2008 roku stowarzyszenie musiało ogłosić upadłość z powodu roszczeń podatkowych ze strony urzędu skarbowego. W sezonie 2008/09 zespołowi wcześnie udało się zapewnić sobie tytuł mistrzowski w lidze regionalnej i wrócić do drugiej ligi.