Franz Thonner (ur. 11 marca 1863 w Wiedniu, zm. 21 kwietnia 1928 w Pradze) – austriacki botanik, eksplorator i etnolog; autor kluczy do oznaczania roślin, obejmujących bardzo duże obszary (świat, kontynenty).
Życiorys i zainteresowania badawcze Studiował najpierw prawo, a następnie nauki przyrodnicze (w Wiedniu i Berlinie), ale prawdopodobnie nie uzyskał żadnego dyplomu. W 1891 ożenił się z Czeszką Marie Svobodą. Dzięki posiadanemu majątkowi mógł pracować nad interesującymi go zagadnieniami, nie zajmując formalnie żadnego stanowiska. Odbył dwie wyprawy badawcze do Konga (wówczas belgijskiego; 1896, 1909); jego doskonałe przygotowanie do prac terenowych obrazuje fakt, że ze 120 okazów roślin zebranych podczas pierwszej wyprawy 50 okazało się nowymi dla badanego obszaru, a 23 – nowymi gatunkami.