W trakcie prowadzonych rozmów kapitulacyjnych 28 września oddziały Dywizji Pancernej „Kempf” prowadziły silne natarcie na odcinek „Zakroczym”. Przy silnym ostrzale artylerii niemieckiej oddziały piechoty wykonały gwałtowny atak na stanowiska VI i VII batalionów 32 pp. Po zaciekłych walkach oddziały niemieckie zdobyły Zakroczym.
Od rana 29 września w Modlinie rozpoczęto przekazywać pododdziałom rozkaz o kapitulacji twierdzy i zaprzestaniu walk. Ze względu na brak dostatecznej łączności rozkazy dotarły z opóźnieniem, na pododcinek „Nowy Dwór” o godz. 8.00, na odcinek „Zakroczym” ok. godz. 9.00, na odcinku „Pomiechówek” o godz. 10.00, gdzie walczył pluton ckm w forcie nr III. Wstrzymanie walki Niemcy wykorzystali, wbrew umowie kapitulacyjnej zaczęli zajmować obiekty i linie obronne. W Zakroczymiu hitlerowcy z pułku piechoty zmotoryzowanej SS-Deutschland dopuścili się zbrodni wojennej na jeńcach rozstrzeliwując 66 jeńców żołnierzy VI i VII batalionów 32 pp. Oraz innych zbrodni na żołnierzach 4 pułku piechoty Legionów. Od godz. 10.00 rozpoczęto składanie broni. Po przewiezieniu żołnierzy do obozów w Mławie, Działdowie i Iłowie, zwolniono większość żołnierzy do domów w połowie października.