Gubernator został nazwany Tōkyō-to chiji (東 京) i jest wybierany bezpośrednio przez społeczeństwo.
Gubernatorzy prefektury Edo Prefektura Edo (1868) # Zdjęcie Imię i nazwisko Kadencja 1 100x100px Mitsue Karasumaru (烏丸光徳) 13 lipca 1868 - 5 października 1868
Gubernatorzy prefektury Tokio 50x50px Prefektura Tokio (1868-1943) # Zdjęcie Imię i nazwisko Kadencja 1 100x100px Mitsue Karasumaru (烏丸光徳) 5 października 1868 - 20 grudnia 1868 2 100x100px Takatō Ōki (大木喬任) 16 stycznia 1869 - 22 sierpnia 1869 3 100x100px Motōsa Mibu (壬生基修) 6 listopada 1869 - 7 września 1871 4 100x100px Kimimasa Yuri (由利公正) 7 września 1871 - 18 sierpnia 1872 5 100x100px Ichiō Ōkubo (大久保一翁) 30 czerwca 1872 - 19 grudnia 1875 6 100x100px Masataka Kusumoto (楠本正隆) 19 grudnia 1875 - 12 grudnia 1879 7 100x100px Michiyuki Matsuda (松田道之) 12 grudnia 1879 - 6 lipca 1882 8 100x100px Akimasa Yoshikawa (芳川顕正) 19 lipca 1882 - 13 czerwca 1885 9 100x100px Hiromoto Watanabe (渡辺洪基) 13 czerwca 1885 - 9 marca 1886 10 100x100px Goroku Takasaki (高崎五六) 9 marca 1886 - 19 maja 1890 11 100x100px Mochiaki Hachisuka (蜂須賀茂韶) 19 maja 1890 - 21 lipca 1891 12 100x100px Tetsunosuke Tomita (富田鐵之助) 21 lipca 1891 - 26 października 1893 13 100x100px Yasushi Miura (三浦安) 26 października 1893 - 14 marca 1896 14 100x100px Michitsune Koga (久我通久) 14 marca 1896 - 12 października 1897 15 100x100px