NARA odkryła, że zawierały materiały niejawne, i 9 lutego zawiadomiła Departament Sprawiedliwości. W rezultacie 30 marca FBI rozpoczęło śledztwo dotyczące obchodzenia się przez Trumpa z dokumentami rządowymi. W maju wielka ława przysięgłych wydała wezwanie obejmujące wszystkie pozostałe dokumenty znajdujące się w posiadaniu Trumpa. Trump poświadczył, że 3 czerwca zwrócił wszystkie pozostałe materiały, jednak FBI uzyskało później dowody, że celowo przenosił dokumenty, aby ukryć je przed własnymi prawnikami i FBI, a zatem nie wykonał wezwania.
Doprowadziło to do przeszukania Mar-a-Lago przez FBI 8 sierpnia 2022. Agenci odzyskali ponad 13 000 dokumentów rządowych, z których ponad 300 było oznaczonych jako niejawne; część dotyczyła tajemnic obrony narodowej chronionych ustawą o szpiegostwie. Po przeszukaniu wszczęto postępowanie cywilne Trump v. United States, w którym sędzia okręgowa Aileen Cannon tymczasowo powołała specjalnego urzędnika sądowego do przeglądu zajętych materiałów.