1 stycznia 1996 w celu wzmocnienia zespołu nastąpiła fuzja klubów z gminy Ballerup. W projekcie uczestniczyły kluby Ballerup Idræts Forening, Grantoftens Idræts Forening, Ballerup Fodbold Club Lundegården i Lille Hema af 1973 oraz Skovlunde IF, na licencji którego klub z nazwą AC Ballerup kontynuował występy w Elitedivisionen. Jednak drużyna tylko rok zagrała na najwyższym poziomie, a przed rozpoczęciem sezonu 2000/01 sekcja kobieca Skovlunde IF zrezygnowała z udziału w AC Ballerup, pozostawiając klub bez drużyny kobiet. AC Ballerup został rozwiązany 30 czerwca 2002, a kobieca drużyna Skovlunde IF w sezonie 2000/01 startowała samodzielnie w rozgrywkach 1. Division. Po trzech latach, w sezonie 2002/03 zespół zwyciężył w pierwszej dywizji i awansował do Elitedivisionen. W 2006, 2007 i 2008 klub osiągnął swój największy sukces, zdobywając brązowe medale mistrzostw, a w 2004 dotarł do finału Pucharu Danii, gdzie przegrał 0:2 z Brøndby IF. W sezonie 2009/10 zajął siódme miejsce w rundzie zasadniczej, a potem w grupie spadkowej był drugim, w wyniku czego klub został sklasyfikowany na szóstej pozycji w tabeli końcowej.
1 czerwca 2010 w wyniku fuzji klubów z gminy Ballerup - Ballerup IF i Skovlunde IF powstał nowy klub Ballerup-Skovlunde Fodbold.
Barwy klubowe, strój, herb, hymn