Powrót do pierwszej drużyny i odrodzenie W styczniu 2006 roku Mijailović dostał szansę powrotu do pierwszej drużyny, dzięki decyzji którą podjęli nowy trener Wisły Dan Petrescu, dyrektor sportowy Grzegorz Mielcarski oraz prezes Ludwik Miętta-Mikołajewicz. W kwietniu Serb wywalczył sobie miejsce w wyjściowym składzie zespołu, którego nie oddał już do końca sezonu. Również w sezonie 2006/2007 grał w wyjściowym składzie we wszystkich meczach jakie rozegrała Wisła pod wodzą Dana Petrescu. Po zwolnieniu Petrescu, niezadowolony z decyzji klubu zawodnik powiedział na łamach Przeglądu Sportowego, że rumuński trener „był zbyt dużym profesjonalistą jak na Wisłę”. U nowego trenera Wisły, Dragomira Okuki, Mijailović również wychodził na boisko w pierwszej jedenastce. W rewanżowym spotkaniu I rundy pucharu UEFA z Iraklisem Saloniki zdobył bramkę z rzutu wolnego, która doprowadziła do dogrywki, w której lepsza okazała się Wisła i dzięki temu awansowała do fazy grupowej Pucharu UEFA. W październiku 2006 roku wystąpił w meczu fazy grupowej Pucharu UEFA z Blackburn Rovers w którym rzekomo dopuścił się rasistowskiego zachowania wobec napastnika przeciwników, Benny’ego McCarthy’ego. Sędzia tamtego spotkania nie stwierdził jednak, aby Serb obrażał południowoafrykańskiego piłkarza.