W skład Komisji wchodzili: dyrektor Departamentu Zaopatrzenia i Farmacji, bądź jego zastępca jako przewodniczący; naczelnik Wydziału Farmacji, bądź jego zastępca – jako sekretarz; 12 — 16 członków powołanych przez Ministra Zdrowia spośród znawców z dziedziny farmacji, chemii, aptekarstwa, medycyny i weterynarii; delegat Ministerstwa Przemysłu i Handlu; delegat Ministerstwa Obrony Narodowej; delegat Ministerstwa Rolnictwa i Reform Rolnych delegat Ministerstwa Pracy i Opieki Społecznej, delegat Państwowego Zakładu Higieny (Dział Chemii), delegat Państwowego Instytutu Naukowego Leczniczych Surowców Roślinnych, delegat Centrali Handlowa Farmaceutyczno-Sanitarna "Centrosan" (Dział Aptek Społecznych), przedstawiciel Naczelnej Izby Aptekarskiej, przedstawiciel Naczelnej Izby Lekarskiej, przedstawiciel Naczelnej Izby Lekarsko-Dentystycznej, przedstawiciel Związku Zawodowego Pracowników Służby Zdrowia (Sekcja Farmaceutyczna).
Komisja Farmakopei z 2001 r. Według ustawy z 2001 r. Prawo farmaceutyczne podstawowe wymagania jakościowe oraz metody badań produktów leczniczych i ich opakowań oraz surowców określa Farmakopea PolskaUstawa z dnia 6 września 2001 r. Prawo farmaceutyczne.