Zmarł 6 października 1657 na atak serca. Jego jedyny syn zmarł w młodym wieku. Książki z prywatnego zbioru zostały sprzedane ok. 1660, po śmierci żony Çelebiego. Część z nich wchodzi obecnie w skład Biblioteki Uniwersyteckiej w Lejdzie.
Dzieła
Większość dzieł Kâtipa Çelebiego pochodzi z lat 1648-1657. Był jednym z najbardziej płodnych autorów osmańskich. Zajął on ważne miejsce w literaturze osmańskiej i islamskiej nie tylko ze względu na liczbę i różnorodność napisanych przez siebie dzieł, ale także na treść i oryginalność tych dzieł. Większość swoich książek tworzył przez wiele lat, dopisując różne fragmenty, wiele z nich nie zostało nigdy ukończonych. Znał języki turecki, arabski i perski. Jest autorem m.in: mały|Mapa Sumatry w pracy Cihânnümâ Kashf aẓ-Ẓunūn ‘an 'asāmī ‘l-Kutub wa'l-funūn (كشف الظنون عن أسامي الكتب والفنون) – słownik bibliograficzny, zawierający informacje na temat około 15000 książek;
Sullam al-Wuṣūl ilā Ṭabaqāt al-Fuḥūl (سلم الوصول إلى طبقات الفحول) – słownik biograficzny zawierający 8561 biogramów;
Taqwīm at-Tawārikh (تقويم التواريخ) – dzieło zawierające historię świata od jego powstania do czasów współczesnych autorowi, oparte na pracach perskich i tureckich, kontynuowane po śmierci Kâtipa Çelebiego przez innych autorów;