W 1849 roku rada kościoła sprzedała Muzeum Narodowemu w Pradze część dokumentów związanych z Janem Amosem Komeńskim. W 1881 roku w celu uporządkowania i skatalogowania zdeponowano część dokumentów w Archiwum Miejskim w Poznaniu.
W 1892 roku archiwum opieką otoczył nowy pastor Wilhelm Bickerich. W 1918 roku odzyskał część materiałów zdeponowanych w Archiwum w Poznaniu. Uzupełnił zbiory o fotokopie dokumentów dotyczących braci czeskich spoza Leszna. Ze sporządzonego przez niego katalogu wiemy, że biblioteka przed wybuchem II wojny światowej liczyła około 2 tysiące woluminów.
Archiwum i biblioteka przetrwały nienaruszone do 1944 roku. Wtedy Niemcy podjęli decyzję o ich ewakuacji. Zbiory zostały odnalezione w latach 50. XX wieku na terenie NRD w Evangelische Brüder-Unität Herrnhuter. Wróciły do Polski w 1961 roku. Wywiezione zbiory odnalazł pracownik Uniwersytetu Warszawskiego Jerzy Śliziński. Jego starania o odzyskanie zbiorów wspierał ówczesny dyrektor poznańskiego archiwum Czesław Skopowski.