Podczas II wojny światowej zbiory biblioteki zostały przez władze niemieckie przewiezione do Krakowa, do siedziby Statistisches Amt. W 1945 r. po reaktywowaniu Głównego Urzędu Statystycznego powróciły do Warszawy. Nie podzieliły tym samym losu zbiorów innych placówek bibliotecznych stolicy, które zostały prawie całkowicie zniszczone we wrześniu 1939 roku, bądź podczas powstania warszawskiego w 1944 roku.
W 1953 r. biblioteka uzyskała nową siedzibę w jednym ze skrzydeł gmachu GUS, zaprojektowanego przez pracownię prof. Romualda Gutta.
W 1968 r. bibliotece nadano statut, przekształcając ją z Biblioteki Urzędu w Centralną Bibliotekę Statystyczną, spełniającą funkcję głównej biblioteki kraju w zakresie statystyki, demografii oraz dziedzin pokrewnych.
Zbiory Zbiory Warszawskiego Komitetu Statystycznego, będące zalążkiem zborów biblioteki liczyły 3 tysiące woluminów.
Centralna Biblioteka Statystyczna gromadzi dzieła naukowe i popularnonaukowe z zakresu statystyki i demografii, nauk społeczno-ekonomicznych, finansów i bankowości, zarządzania, informatyki, poligrafii, bibliotekoznawstwa. Biblioteka otrzymuje egzemplarz obowiązkowy wydawnictw GUS.