Był skarbnikiem Zarządu Towarzystwa Opieki nad Grobami Bohaterów w Białymstoku.

Od 1930 roku w pracy w parafii wspierał go najpierw jako adiunkt (wikariusz), zaś od 1935 roku jako drugi proboszcz ks. Benno Adolf Kraeter. W 1938 roku ustąpił z urzędu proboszcza i przeszedł na emeryturę (funkcję proboszcza objął ks. Benno Adolf Kraeter). Szczegółowe informacje na temat ostatnich lat życia Teodora Zirkwitza nie są znane. Zmarł 3 marca 1943 w Gdańsku-Wrzeszczu i tam też został pochowany.

Rodzina Był żonaty z Wiktorią Idą. Jego syn, Eryk był sędzią śledczym, a w czasie okupacji niemieckiej działał w ramach polskiej konspiracji niepodległościowej. Wnuczka Teodora Zirkwitza – Irena Zirkwitz (1921–1944), zginęła natomiast w pierwszych dniach powstania warszawskiego jako łączniczka I Obwód "Radwan" (Śródmieście) Warszawskiego Okręgu Armii Krajowej.

Upamiętnienie W 2000 roku jego nazwisko znalazło się w plebiscycie Białostoczanie XX wieku organizowanym przez „Gazetę Wyborczą”, Radio Białystok oraz Telewizję Białystok. Teodor Zirkwitz uplasował się na przedostatnim miejscu.