W 1575 kościół odwiedził prałat Pietro Dusina, delegat apostolski. W swoim raporcie nazwał świątynię „Chiesa Della Beata Vergine Assunta detta di Ceppuna nel Territorio Marsa”. Znaczy to, że przydomek „Ta’ Ċeppuna” kościół nosił od początków swojego istnienia.

II wojna światowa Podczas ostatniej wojny cały teren Klubu Sportowego Marsa znalazł się w rękach Brytyjczyków i dlatego również ucierpiał z powodu ataków powietrznych. Kościół, wówczas wykorzystywany jako magazyn, został trafiony bombami i zawalił się, lecz wkrótce potem został odbudowany na tym samym fundamencie co stary i w tym samym stylu.

Odrestaurowanie Przez lata zarówno pogoda, jak i inne czynniki wyrządziły wiele szkód w budynku kaplicy. Kaplica została odrestaurowana we współpracy z Din l-Art Ħelwa po raz pierwszy w latach 90. XX wieku. W 2006 kaplica została odrestaurowana przez Ministerstwo Zasobów i Infrastruktury. Prace renowacyjne trwały od 10 maja do 1 sierpnia tego roku. 28 grudnia 2006 odnowiony kościół został poświęcony przez ks.