Bronisław Deskur dowodził uderzeniem sił powstańczych na Radzyń 22 stycznia 1863. Oddział uzbrojony w 40 strzelb i 100 kos zdobył 10 armat, lecz nie mógł ich zabrać ze sobą. 15 lutego brał udział w potyczce pod Warelami, a 4 i 5 maja w bitwie pod Stokiem. 13 maja 1863 dowodził kawalerią w zasadzce na pociąg wojskowy w okolicach Kietlanki. 23 maja 1863 roku uczestniczył w bitwie pod Łączką. Służył w oddziałach powstańczych Ignacego Myszkowskiego i Karola Fryczego.
W kilka tygodni po bitwie pod Łączką został mianowany majorem kawalerii i włączony do oddziału pułkownika Heindreicha. Latem 1863 roku otrzymał misję utworzenia lotnego dywizjonu Strzelców Konnych w Galicji, na co otrzymał 30 tysięcy rubli. W połowie sierpnia był w Krakowie, gdzie spotkał się z żoną.
Misja nie powiodła się, Deskur został aresztowany i osadzony we Lwowie, później w Ołomuńcu, skąd udało mu się uciec. Powtórnie aresztowany i więziony w Rzeszowie i Opawie, skąd powtórnie uciekł.