Wypromował 10 doktorów, 116 magistrów inżynierów i 34 inżynierów. Recenzował 18 wniosków na stanowisko i tytuł profesora, 34 prace habilitacyjne i 31 prac doktorskich oraz 234 prace dyplomowe. Uczestniczył w pracy 63 komisji doktorskich i habilitacyjnych, był członkiem 32 komitetów naukowych konferencji. Recenzował ok. 200 projektów badawczych (KBN, MNiSW, NCN, NCBiR) i ok. 450 wniosków o finansowanie dużej infrastruktury badawczej (MNiSW)Prof. dr hab. dr h.c. Jan Kucharski w witrynie UWM w Olsztynie (dostęp 12.11.2023). Jest autorem ok. 300 oryginalnych publikacji naukowych. Pełnił liczne funkcje w uczelni, był prodziekanem (1996–1997) i dziekanem (1997–1999; 1999–2002; 2002–2005), kierownikiem Katedry Mikrobiologii (1988-2009), członkiem Senatu (1993-2012).
Sprawował także liczne funkcje poza uczelnią, m.in. był przewodniczącym Komitetu Gleboznawstwa i Chemii Rolnej Polskiej Akademii Nauk (2007–2012), przewodniczącym Komisji Akredytacyjnej kierunku rolnictwo uczelni rolniczych (2005–2009), przewodniczącym Konferencji Dziekanów wydziałów rolniczych uczelni polskich (2002–2005)Złota księga nauk przyrodniczych 2009. Red. Krzysztof Pikoń. Wydawnictwo Helion Mastermedia Gliwice 2009, s. 182-183. ISBN 978-83-926326-2-7.