W 1833 r. wziął ślub w Kornelią z Romanów, córką Ignacego i Cecylii z Sokołowskich, stanu szlacheckiego i Sędziostwo Trybunału Cywilnego pierwszey Instancyi Województwa Augustowskiego. Miał dwójkę dzieci: Cecylię Antoninę (ur. 1834, zm. 1837) oraz Władysława (ur. 1836, poeta, powstaniec z 1863 r., zm. 1865 w Pizie). W 1854 r. został inspektorem gimnazjum łomżyńskiego, a w 1862 r. przeszedł na emeryturęEdward Strumpf, Jakób Waga (Z powodu setnej rocznicy urodzin), [w:] Wszechświat. Tygodnik popularny, poświęcony naukom przyrodniczym, t. XIX, nr 44, Warszawa 4 listopada 1900 r., s. 689–692.. Zmarł w 1872 r. w Łomży. W „Tygodniku Illustrowanym” Henryk Załęski tak opisuje pogrzeb: Zmarł w 72 roku życia d. 23 lutego, mając przeszło lat 40 literackiego zawodu, służby zaś publicznej 37. Wyprowadzenie zwłok ś.p. Jakuba Wagi odbyło się 25 lutego. Trumnę z domu do kościoła nieśli nauczyciele szkół; nazajutrz zaś, po żałobnem nabożeństwie, przyjaciele na swych barkach ponieśli ją dalej aż na cmentarz. Ziemia przyjęła w swe łono pożytecznego i zacnego pracownikaHenry Załęski, Jakub Waga, [w:] Tygodnik Illustrowany, t. IX, nr 224, Warszawa 13 kwietnia 1872 r., s. 189–190..