W 1932/33 po reorganizacji systemu lig i wprowadzeniu najwyższej ligi Éirendivisioun poziom 3.Divisioun spadł do piątego stopnia. W sezonach 1935/36 i 1937/38 klubowi udało się zagrać na czwartym poziomie w 2.Divisioun, ale za każdym razem spadał z powrotem do 3.Divisioun. Od 1940 roku, kiedy Luksemburg był okupowany przez nazistowskie Niemcy, zwany był Fußballklub Mersch. Grał w rozgrywkach lokalnych mistrzostw Niemiec, ale nigdy nie zakwalifikował się do 1. Klasse Luxemburg (D3). W 1944 roku po wyzwoleniu powrócił do pierwotnej nazwy klubu FC Marisca Mersch.
W sezonie 1945/46 klub wznowił udział w rozgrywkach mistrzostw Luksemburgu, zajmując czwarte miejsce w 3.Distrikt 3.Divisioun i awansując do 2.Divisioun. W następnym sezonie 1946/47 zdobył wicemistrzostwo 1.Distrikt 2.Divisioun i promocję do Promotioun (D3). Na trzecim poziomie występował aż do sezonu 1956/57, kiedy to zajął 11.miejsce. W wyniku reorganizacji lig zespoły zajmujące 11. i 12. miejsce spadały o dwie ligi niżej. Kolejny sezon 1957/58 drużyna rozpoczęła w 3.Divisioun (D5).