Wydanie Godzilla Minus One miał uroczystą premierę 18 października 2023 roku w kinie Toho Cinema w budynku Shinjuku Toho w Tokio. Film był utworem zamykającym 36. Międzynarodowy Festiwal Filmowy w Tokio 1 listopada 2023 roku, gdzie został pokazany z angielskimi napisami. Następnie 3 listopada film został wydany w całej Japonii, aby uczcić 70. rocznicę powstania serii. Film został wyemitowany w 500 kinach w całym kraju – w tym w formatach IMAX, Dolby Cinema, 4DX, MX4D i ScreenX – co czyni go jedną z największych dotychczas krajowych dystrybucji Toho. 23 listopada w wybranych japońskich kinach ukazała się także anglojęzyczna wersja z napisami.
Godzilla Minus One pojawił się 1 grudnia 2023 roku w kinach amerykańskich i europejskich. Kraje te obejmowały Austrię, Niemcy, Liechtenstein, Luksemburg, Szwajcarię kraje Beneluksu, Francję, Włochy, kraje nordyckie, Polskę i Hiszpanię.
W maju 2024 roku film trafił na serwis streamingowy Prime Video wyłącznie w Japonii. 1 czerwca tego samego roku otrzymał dystrybucję streamingową w serwisie Netflix na pozostałe rynki. Na potrzeby polskiego oddziału powstał dubbing, zrealizowany przez Hiventy Poland w reżyserii Michała Podsiadły.