W listopadzie tego samego roku został wybrany na wiceprzewodniczącego klubu parlamentarnego PiS jako przedstawiciel Solidarnej Polski (w maju 2023 przemianowanej na Suwerenną Polskę).
Na początku października 2020 powołany na sekretarza stanu w Ministerstwie Środowiska i pełnomocnika rządu do spraw leśnictwa i łowiectwa. W tym samym miesiącu, po przekształceniach w strukturze rządu, został sekretarzem stanu w Ministerstwie Klimatu i Środowiska. W wyborach w 2023 kolejny raz z powodzeniem ubiegał się o poselską reelekcję (z wynikiem 18 587 głosów). W grudniu tego samego roku zakończył pełnienie funkcji w administracji rządowej. Jesienią 2024 wraz z Suwerenną Polską przystąpił do PiS.
20 lutego 2025 w Sejmie krzyknął „Kula w łeb!” pod adresem Donalda Tuska w trakcie krytycznego wobec premiera wystąpienia Zbigniewa Ziobry. W reakcji na te słowa Krzysztof Brejza złożył zawiadomienie o możliwości popełnienia przestępstwa do Prokuratury Okręgowej w Warszawie, w której wszczęto postępowanie sprawdzające. 21 lutego poseł został ukarany karą pieniężną przez Prezydium Sejmu na wniosek Szymona Hołowni.