Runda wstępna W tej rundzie miało spotkać się pięciu zwycięzców pucharu regionalnego i pięć najgorzej sklasyfikowanych drużyn Prva Liga 2015/16. Donji Srem został rozwiązany po zakończeniu sezonu, w związku z czym Mladost Bački Jarak otrzymał wolny los. Sloga Petrovac nie otrzymała licencji na następny sezon z powodów finansowych, dlatego też Dinamo Vranje zostało przesunięte do następnej rundy jako najwyżej sklasyfikowany zespół. Rywal Dinama, , otrzymał wolny los.
Uczestnicy tej fazy rozgrywek reprezentowali w sezonie 2016/2017 następujące poziomy ligowe: drugi poziom – 2 drużyny: trzeci poziom – 5 drużyn: czwarty poziom – 2 drużyny:
| colspan=3 style="background-color: cornsilk; text-align: center" | 7 września 2016
Drabinka W polu po lewej stronie nazwy drużyny podano jej poziom ligowy w sezonie 2016/2017.
1/16 finału Uczestnicy tej fazy rozgrywek reprezentowali w sezonie 2016/2017 następujące poziomy ligowe: pierwszy poziom – 16 drużyn: drugi poziom – 12 drużyny: trzeci poziom – 3 drużyn: czwarty poziom – 1 drużyna:
| colspan=3 style="background-color: cornsilk; text-align: center" | 20 września 2016
| colspan=3 style="background-color: cornsilk;