W latach 2004–2005 był wielokrotnie powoływany do seniorskiej reprezentacji Walii przez selekcjonerów Marka Hughesa i Johna Toshacka, jednak zagrał tylko w jednym meczu: za kadencji Marka Hughesa 30 maja 2004 roku na Racecourse Ground we Wrexham w wygranym 1:0 meczu towarzyskim z reprezentacją Kanady, w którym zastąpił w drugiej połowie Danny’ego Coyne’aWales 1-0 Canada [data dostępu: 2004-05-30] ..
Kariera trenerska Martyn Margetson jeszcze w trakcie kariery piłkarskiej został trenerem bramkarzy Cardiff City, którym był do 2011 roku. Jeszcze w trakcie pracy w klubie, 15 stycznia 2011 roku został mianowany przez selekcjonera reprezentacji Walii, Gary’ego Speeda trenerem bramkarzyMargetson appointed Wales goalkeeping coach [data dostępu: 2011-01-15] .. Następnie był trenerem bramkarzy West Ham United (2011–2014) oraz ponownie Cardiff City (2014–2017)Cardiff City: Martyn Margetson offers ‘experience’ – Russell Slade [data dostępu: 2014-10-27] ..