Dorobek naukowy Friedrich Schaller był prezesem Stowarzyszenia Biologów Niemieckich () od 1962 do 1968 oraz prezesem Niemieckiego Towarzystwa Zoologicznego () w latach 1970–1973. Przez osiem lat był także recenzentem Niemieckiej Wspólnoty Badawczej (Deutsche Forschungsgemeinschaft).
Jego głównymi obszarami badawczymi były: zoologia glebowa i etologia zwierząt glebowych – zwłaszcza skoczogonków. Prowadził też badania ekologiczne w tropikach Ameryki Południowej – zwłaszcza w Amazonii i Sudanie – na zwierzętach glebowych i rybach.
Stworzył około 200 artykułów i rozdziałów w książkach na temat bioakustyki ciem i ryb amazońskich, krytyki języka i terminologii biologicznej, a także zagadnień współczesnej biologii oraz jej historii. Był współredaktorem lub redaktorem branżowych czasopism (Oecologia, Zoologe, Zoologica).
Nagrody i wyróżnienia 1964 – członek zwyczajny Towarzystwa Naukowego Brunszwiku () 1987 – doktor honoris causa Uniwersytetu w Ulm 1993 – Medal Fabriciusa Niemieckiego Towarzystwa Entomologii Ogólnej i Stosowanej (niem. skr. DGaaE) 1993 – członek korespondent Austriackiej Akademii Nauk 1995 – Medal Gregora J. Mendla Czeskiej Akademii Nauk 1998 – Nagroda im. Ernsta Jüngera w dziedzinie entomologii Badenii-Wirtembergii