W lipcu 2000 roku klub przeniósł się do miejscowości Vlimmeren w gminie Beerse, gdzie dołączył do Vlimmeren Sport i stał się jego sekcją dla kobiet, zmieniając nazwę na Vlimmeren Sport. W sezonie 2001/02 została organizowana Derde Klasse (D3), do której zakwalifikował się klub. W pierwszym jej sezonie zespół wygrał jej serię i od razu awansował do Tweede Klasse. Po dwóch latach, w sezonie 2003/04 drużyna wygrała mistrzostwo drugiej ligi, zdobywając historyczny awans do Eerste Klasse (D1). W debiutowym sezonie 2004/05 na najwyższym poziomie zajął 9.miejsce. W kolejnych sezonach plasował się na 8., 3., 6., 6. i 10.pozycjach.
Klub Lierse SK miał już sekcję żeńską, ale kobieca drużyna A grała tylko w drugiej lidze prowincjonalnej i dlatego potrzebowała jeszcze co najmniej kilka lat, zanim mogłaby ewentualnie dotrzeć do najwyższej ligi. Dlatego w celu fuzji dział kobiecy Vlimmeren Sport został przeniesiony latem 2010 roku do nowo powstałego klubu WD Lierse SK, który dołączył do Belgijskiego Związku Piłki Nożnej pod numerem rejestracyjnym 9545. Zespół zajmował trzecie miejsce w pierwszej lidze w 2011 i 2012. W 2012 roku wcześniej niezależna spółka WD Lierse SK została w pełni zintegrowana z Lierse SK.