Części ciała migdałowategoJ. Moryś, Podstawy anatomiczne procesów zapamiętywania i emocji, w: Neuronalny świat umysłu, Krzysztof Jodzio (red. nauk.), s. 23, Oficyna Wydawnicza „Impuls”, Kraków 2005. W obrębie ciała migdałowatego wyróżnia się dwie części: korowo-przyśrodkową – starsza filogenetycznie; spełnia rolę pobudzającą. Przylega do zakrętu półksiężycowatego (ang. semilunar gyrus) i dzięki temu posiada połączenie do prążka węchowego bocznego. Zbudowana jest z trzech głównych kompleksów jąder: korowego przyśrodkowego środkowego podstawno-boczną; młodsza filogenetycznie; spełnia rolę hamującą. Znajduje się pod wpływem kory. Zbudowana jest z dwóch dużych kompleksów jąder: bocznego podstawnego.
Informacje docierające do ciała migdałowatego dochodzą do zespołu jąder bocznych, skąd przekazywane są do zespołu jąder podstawnych. W ich obrębie zachodzi analiza i przetworzenie napływających informacji oraz porównanie ich z zapamiętanymi wzorcami pamięci emocjonalnej. Wynik zostaje przekazany do jądra środkowego, który wysyła na zewnątrz polecenia wykonawcze. Informacje docierają do podwzgórza, pnia mózgu i narządów efektorowych.