Następnie trasa Zugspitzbahn wznosi się i przechodzi wiaduktem nad linią Außerfernbahn, dalej znajduje się przystanek Kreuzeck-/Alpspitzbahn przy dolnych stacjach kolei linowych Kreuzeckbahn oraz Alpspitzbahn. Dalej znajduje się przystanek osobowy Hammersbach zlokalizowany w części Grainau o tejże nazwie. 7,5-kilometrowy odcinek o trakcji klasycznej kończy się na stacji Grainau. W stacji Grainau znajdują się tory odstawcze wraz z halą naprawczą, gdzie serwisowane są pojazdy Zugspitzbahn.
W Grainau zaczyna się górski odcinek trasy wyposażony w trzecią szynę zębatą. W przypadku pociągów obsługiwanych taborem jednotrakcyjnym, pasażerowie przesiadają się do drugiego pociągu na stacji Grainau. Przez następne 3,2 km pociągi pokonują wzniesienie o maksymalnym nachyleniu 150‰ do stacji Eibsee nazwanej tak od jeziora o tejże nazwie. Jest ona zlokalizowana w pobliżu dawnej dolnej stacji kolei linowej Eibsee-Seilbahn, a od 2017 roku przy dolnej stacji kolei linowej Seilbahn Zugspitze prowadzącej bezpośrednio na szczyt Zugspitze. Na dalszej trasie maksymalne nachylenie wynosi 250‰. Pociągi pokonują następnie krótki tunel o długości 70 m oraz przejeżdżają przez nasyp o wysokości 12 m, by po 4,3 km dotrzeć do przystanku osobowego Riffelriß.