Na obszarze gminy San Martín Jilotepeque nie zidentyfikowano żadnego innego boiska z tego okresu, choć przypuszcza się, że trzy z czterech boisk z okresu klasycznego znajdujących się w innych miejscach pozostawały w użyciu.
Na krótko przed hiszpańskim podbojem miasto pod wodzą Achi Q'alela zbuntowało się przeciwko Kaqchikelom z Iximché. Przypuszczalnie jednak doszło do zawarcia pokoju i wspólnego sprzymierzenia się z Hiszpanami. Władcy Iximché postanowili wejść w sojusz z Hiszpanami i pomóc im w pokonaniu sąsiedniego królestwa Tzʼutuhil. Konkwistadorzy zatrzymali się w Iximché jedynie na krótko, po czym ruszyli w dalej. Do stolicy Kaqchikelów powrócili 23 lipca 1524 roku. Szybko zaczęli domagać się w hołdzie złota, co pogorszyło dotychczasowy sojusz, a w ostateczności doprowadziło do jego zerwania i wojny. W wyniku tego część mieszkańców porzuciła miasto i uciekła do lasów oraz na wzgórza, a część schroniła się w Mixco Viejo (Jilotepeque Viejo). Kiedy Hiszpanie i je podbili, przenieśli mieszkańców do San Martín Jilotepeque, a samo miasto nie zostało już ponownie zasiedlone i popadło w ruinę.