System rozgrywek Rozgrywki o Puchar Chorwacji w sezonie 2023/2024 składały się z 1/8 finału, ćwierćfinałów, półfinałów i finału. Nie był grany mecz o 3. miejsce. Uczestniczyli w nich: drużyny grające w sezonie 2023/2024 w Superlidze oraz zwycięzcy pucharów regionalnych. We wszystkich rundach rywalizacja toczyła się w systemie pucharowym, a o awansie decydowało jedno spotkanie.
Przed każdą rundą odbywało się losowanie wyłaniające pary meczowe. Losowanie 1/8 finału miało miejsce 3 listopada, ćwierćfinałów – 24 listopada, natomiast półfinałów – 9 lutego.
Przed losowaniem 1/8 finału drużyny podzielone zostały na rozstawione i nierozstawione. Rozstawionych było osiem najlepszych zespołów Superligi w sezonie 2022/2023.
Drużyny rozstawione1.HAOK Mladost Zagrzeb2.MOK Mursa Osijek3.OK Ribola Kaštela4.OKM Centrometal5.OK Kitro Varaždin6.OK Medicinar Trnje7.OK Rovinj8.OK Split Drużyny nierozstawioneMOK ČazmaMOK MarsoniaMOK RijekaMOK UmagOK SisakOK ZadarOK Zrinski Nuštar
Do drużyn rozstawionych dolosowywano drużyny nierozstawione. W ten sposób powstały pary meczowe 1/8 finału.