Siatkę tworzyło 29 przewoźników, którzy połączyli Kraków z 124 miastami.
Rozwój portu lotniczego XXI wiek charakteryzował się dla krakowskiego portu lotniczego szybkim wzrostem ruchu. W latach 2000–2020 średnioroczny wzrost wynosił 18%, a liczba obsłużonych pasażerów z 517 tysięcy w 2000 wzrosła do 8,41 miliona w 2019. W 2024 liczba ta wzrosła do rekordowych 11,1 milionów.
14 grudnia 2016 Polska Agencja Żeglugi Powietrznej oraz Zarząd Kraków Airport podpisali list intencyjny dotyczący współpracy mającej na celu uruchomienie na krakowskim lotnisku naziemnego systemu GBAS (Ground Based Augmentation System), systemu wspomagania nawigacyjnego kontroli ruchu lotniczego, który jest użytkowany na największych lotniskach w Stanach Zjednoczonych i w Europie.
W 2017 zarząd portu przyjął strategię rozwoju lotniska do 2036. Prace planowano podzielić na trzy fazy, a w razie konieczności poszczególne zadania miały zostać przesunięte na kolejne etapy. Plan zakładał powstanie między innymi nowej drogi startowej, hangaru orasz bazy paliwa, a także rozbudowę terminala pasażerskiego i płyty postojowej samolotów oraz przesunięcie terminala cargo.