Rodzaje te wchodzą w skład dwóch plemion – Polygoneae i Persicarieae. Plemię Polygoneae obejmuje 7–8 rodzajów, w tym: Calligonum, Atraphaxis, Polygonum (sensu stricto), Fallopia, Pteropyrum.
W wąskim ujęciu w obrębie rodzaju Polygonum (sensu stricto) wyróżnia się w zależności od ujęcia wielu drobnych taksonów od ok. 20 do ok. 65 gatunków.
Pozycja rodzaju na tle kladogramu podrodziny Polygonoideae
Gatunki rdestów występujące w Polsce Spośród gatunków zaliczanych do rodzaju Polygonum w wąskim ujęciu na terenie Polski występują (wszystkie reprezentują sekcję Polygonum):
rdest nadbrzeżny Polygonum oxyspermum C. A. Mey. & Bunge ex Ledeb. s. – gatunek w Polsce wymarły rdest piaskowy Polygonum arenarium Waldst. & Kit. – efemerofit rdest pokrewny Polygonum affine D. Don rdest ptasi Polygonum aviculare L. rdest rozłożysty Polygonum patulum M. Bieb. – efemerofit
Z gatunków zaliczanych do rodzaju Polygonum sensu lato w Polsce występują (jako rodzime lub dziczejące):
klasyfikowane do rodzaju Bistorta: rdest himalajski Polygonum amplexicaule D.Don – właśc. Bistorta amplexicaulis (D. Don) Greene rdest wężownik Polygonum bistorta L. – właśc. Bistorta officinalis Delarbre rdest żyworodny Polygonum viviparum L. – właśc. Bistorta vivipara (L.) Delarbre