Baraż o NIFL Premiership Institute piąta drużyna NIFL Championship 1 zagrała w barażu o Premiership. Wyżej sklasyfikowane zespoły , i nie ubiegały się o wymaganą licencję w rezultacie nie zakwalifikowały się do barażu. Mecze pierwotnie miały się odbyć 6 i 10 maja 2016, ale drugi mecz został przełożony z powodu protestów Warrenpoint Town.
Protest dotyczył decyzji IFA o nienałożeniu kary na Carrick Rangers po tym, jak ich menadżer Gary Haveron mimo nałożonego zakazu trzech meczów, był na ławce rezerwowych 23 kwietnia podczas meczu 37. kolejki przeciwko Dungannon Swifts, który wygrali 3-1. Uwzględnienie protestu skutkowałoby nałożeniem na Carrick minimalnej grzywny w wysokości 350 funtów, zweryfikowaniem meczu jako walkower 0-3. Odliczenie trzech punktów przesunęłoby Carricka na sam dół tabeli, Ballinamallard awansowałby na dziesiąte bezpieczne miejsce, a Warrenpoint na jedenaste. 18 maja po przesłuchaniu dyscyplinarnym protest oddalono, a drugi etap play-off został przesunięty na 22 czerwca.
Ballinamallard United wygrał 5-4 w dwumeczu z Institute baraż o miejsce w NIFL Premiership na sezon 2016/2017.