Część piątą i szóstą posiadał Jan Miłkowski.
W roku 1680 Miłkowa była nadal mocno podzielona, ale prawie wszystkie części skupił w swoim ręku Jan Miłkowski. Do niego należała dawna część pierwsza, druga oraz trzecia i czwarta odkupiona od Jana i Kaspra Siemków oraz część szósta. Część piąta należała do Mateusza Miłkowskiego.
W XVI wieku wieś dzielono na dwie części Miłkową Wyżną i Miłkową Niżną. Według Maurycego Maciszewskiego, autora hasła "Miłkowa" w Słowniku geograficzny Królestwa Polskiego i innych krajów słowiańskich, końcu XIX wieku właścicielem majątku w Miłkowej był Gustaw Siemiński. Jego posiadłość obejmowała: 297 morgów gruntów ornych, 11 morgów łąk, 80 morgów pastwisk oraz 43 morgi lasu. Chłopi w tym czasie gospodarowali na 218 morgach gruntów ornych, 22 morgach łąk i 83 morgach pastwisk. Wieś liczyła 380 mieszkańcówSłownik geograficzny Królestwa Polskiego i innych krajów słowiańskich, t. Tom VI, s. 434, http://dir.icm.edu.pl/pl/Slownik_geograficzny/Tom_VI/434 [dostęp 2025-06-28]..